メトロニダゾールは，トリコモナス原虫のDNAの二重鎖切断等の機能障害を介して分裂増殖を抑制することにより抗トリコモナス作用を示す．

メトロニダゾールは，原虫内のニトロ還元酵素系の反応によって還元され活性型となり，これが微生物のDNAの二重鎖切断等の機能障害を起こし，分裂増殖を抑制して抗原虫作用を示す．